De natuurvoedingswinkel anno 1999 lijkt in weinig opzichten meer op zijn vooloper. Het rommelige winkeltje van weleer is in veel, maar lang niet alle gevallen veranderd in een kleine supermarkt met winkelwagentje, moderne kassa’s en aanbiedingen. U vindt er een compleet assortiment voedingsmiddelen, schoonmaakartikelen en cosmetica, net zoals in elke ‘gewone’ supermarkt. Ook ‘luxe’ producten, zoals snoepjes, diepvriesproducten en snacks. Verwarrend blijft dat veel natuurvoedingswinkels ook gewone gangbare artikelen en reformproducten verkopen die niet altijd van biologische oorsprong zijn. Bij het publiek is dat lang niet altijd bekend, en helaas ontbreekt er nogal eens informatie over.
In de reactie op de toenemende concurrentie van de supermarkten en om de voordelen van schaalvergroting beter te kunnen benutten, zijn de natuurvoedingswinkels zich gaan bundelen. Een groot deel van de natuurvoedingswinkels is aangesloten bij de eind 1994 opgerichte Vereniging van Winkels in de Natuurvoedingsbranche (VWN), een organisatie die de belangen van alle natuurvoedingswinkels behartigt.